Hacettepe Üniversitesi Aşı Enstitüsü’nün misyonu; toplumsal, ekonomik ve bilimsel gelişmeye katkıda bulunmak üzere; aşı alanında en üst düzeyde eğitim vermek, nitelikli akademisyenler yetiştirmek, aşı ile ilgili bilgi üretilmesini ve kullanılmasını sağlamak, aşı çalışmalarına ilişkin konularda farkındalık ve duyarlılık yaratmak, paydaşlarla işbirliği kurmak, eğitim verilen öğrencilerin alana bilimsel katkı sağlayabilecek çalışmalar yapabilecek şekilde yetiştirilmesini amaçlamaktadır.